Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gsx1P31315 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms