Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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