Protein–RNA interactions for Protein: P25799

Nfkb1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfkb1P25799 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nfkb1P25799 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms