Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms