Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PtpraP18052 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms