Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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