Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Znf271P15620 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms