Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RhoP15409 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RhoP15409 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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