Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P10404 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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P10404 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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P10404 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
P10404 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
P10404 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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