Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Becn2P0DM65 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Becn2P0DM65 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms