Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxb7P09024 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms