Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P01735 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P01735 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P01735 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P01735 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms