Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CopeO89079 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CopeO89079 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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CopeO89079 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CopeO89079 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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