Protein–RNA interactions for Protein: O88796

Rpp30, Ribonuclease P protein subunit p30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp30O88796 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Rpp30O88796 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rpp30O88796 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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