Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Copb2O55029 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Copb2O55029 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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