Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
ChkaO54804 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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