Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc4O35988 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms