Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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