Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Opn1mwO35599 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
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