Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Prrt1O35449 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrt1O35449 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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