Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Hps1O08983 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Hps1O08983 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Hps1O08983 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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