Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccer2J3QPU5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms