Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm5225J3QPL3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm5225J3QPL3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms