Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
BC024978J3QPC3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms