Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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Gm21818J3KMS6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21818J3KMS6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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