Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21863J3KMP8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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