Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usp9yF8VPU6 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usp9yF8VPU6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Usp9yF8VPU6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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