Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ccdc71lE9Q4T4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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