Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc8E9PWG2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms