Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gbp4A4UUI3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gbp4A4UUI3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms