Protein–RNA interactions for Protein: A2AVA0

Svep1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svep1A2AVA0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Svep1A2AVA0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms