Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms