Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8nlA2ABX0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbbp8nlA2ABX0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms