Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Clip2Q9Z0H8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Clip2Q9Z0H8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Clip2Q9Z0H8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Clip2Q9Z0H8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clip2Q9Z0H8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Clip2Q9Z0H8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Clip2Q9Z0H8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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