Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Nek3Q9R0A5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Nek3Q9R0A5 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms