Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc2lQ9JME7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms