Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rabgef1Q9JM13 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rabgef1Q9JM13 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Rabgef1Q9JM13 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rabgef1Q9JM13 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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