Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ap3m1Q9JKC8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms