Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ush1cQ9ES64 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ush1cQ9ES64 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms