Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Tmem43Q9DBS1 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tmem43Q9DBS1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tmem43Q9DBS1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tmem43Q9DBS1 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Tmem43Q9DBS1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem43Q9DBS1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem43Q9DBS1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms