Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
SrpraQ9DBG7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms