Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms