Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Snx5Q9D8U8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm37057-201ENSMUST00000192624 1916 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx5Q9D8U8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms