Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q9D7E4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms