Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Cldn23Q9D7D7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms