Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PrameQ9D4Z5 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
PrameQ9D4Z5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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PrameQ9D4Z5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PrameQ9D4Z5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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