Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sgms2Q9D4B1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms