Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt20Q9D312 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms