Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Trappc6bQ9D289 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Trappc6bQ9D289 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Trappc6bQ9D289 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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