Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lmbr1lQ9D1E5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms